Centrum Badań DNA

125 Neisseria meningitidis (meningokoki)- test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA dwoinki zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych ( Neisseria meningitidis ). Neisseria meningitidis jest bardzo zjadliwą bakterią Gram(-). Rezerwuarem tej bakterii w organizmie człowieka są górne drogi oddechowe (jama nosowo-gardłowa, 10-20% zdrowych osób). Inwazja dwoinki na układ krwionośny powoduje całe spektrum chorób, od łagodnej i krótkotrwałej bakteriemii, aż po gwałtowną infekcję ogólnoustrojową, która szybko kończy się zgonem osoby zarażonej. Głównym objawem menigokokemii jest zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. W rzadszych przypadkach możliwe są również inne objawy, związane z infekcją innych organów, takich jak osierdzie, stawy czy oczy. Meningokoki są przenoszone drogą kropelkowa lub poprzez bezpośredni kontakt z osobą zakażoną. W pierwszej kolejności dochodzi do asymptomatycznego zakażenia górnych dróg oddechowych, które w większości przypadków jest przejściowe i ustępuje w ciągu kilku tygodni. W sporadycznych przypadkach może jednak dojść do przedostania się bakterii do układu krążenia i rozwoju choroby.

122 Chlamydophila pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Chlamydophila pneumoniae w wymazach z górnych dróg oddechowych. Bakteria ta przenoszona jest drogą kropelkową i jest uznanym czynnikiem etiologicznym zakażeń górnych i dolnych dróg oddechowych. Ponadto może rozprzestrzenić się do innych części ciała, w tym zainfekować tkankę nerwową, mózg, mięśnie, nerki, drogi moczowo - płciowe, wątrobę, stawy, nabłonek naczyń krwionośnych, jak i system immunologiczny. Bakterie te wywołują między innymi zapalenie płuc, oskrzeli, zatok, ucha i gardła. Ch. pneumoniae podejrzewana jest także o udział w patogenezie choroby wieńcowej, astmy, choroby Alzheimera, a nawet miażdżycy. Z wieloletnich obserwacji wynika, że osoby zainfekowane tą bakterią częściej niż inne przechodzą zawał serca, udar mózgu i cierpią na nadciśnienie oraz bóle stawów. Większość zakażeń to infekcje bezobjawowe lub o łagodnym przebiegu. Test ten charakteryzuje się bardzo wysoką czułością i swoistością. Pozwala stwierdzić nosicielstwo jak i aktywne zakażenie już w kilka dni po infekcji umożliwiając tym samym wczesne podjęcie leczenia.

124 Bordetella pertussis - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu DNA pałeczki krztuśca (Bordetella pertussis) w wymazie z jamy nosowo-gardłowej. Krztusiec jest obecnie rzadko występującą chorobą dzięki stosowaniu szczepień ochronnych. Badania wykazały jednak, że odporność poszczepienna przeciwko krztuścowi zanika po około 12 latach. Dlatego coraz więcej przypadków krztuśca pojawia się wśród dzieci w wieku szkolnym i u młodzieży. Na krztusiec chorują również dorośli, którzy już dawno stracili odporność poszczepienną, choroba przebiega u nich łagodniej niż u dzieci lub przyjmuje nietypową postać zapalenia oskrzeli. W przebiegu krztuśca pojawia się napadowy kaszel prowadzący do duszności. Przebycie krztuśca pozostawia trwałą odporność.

120 Haemophilus influenzae - jakościowo,  PCR

Test polega na wykrywaniu DNA bakterii Haemophilus influenzae w wymazie z jamy nosowo-gardłowej lub we krwi. Haemophilus influenzae jest bakterią Gram ujemną, która może być fizjologicznym składnikiem mikroflory bakteryjnej górnych dróg oddechowych (nosicielstwo u dzieci 60-90%, u dorosłych 35%). Wyodrębniono 6 typów tej bakterii, oznaczonych literami od a do f. Bakteria ta jest jednym z najczęstszych czynników etioliologicznych zakażeń dróg oddechowych. Zakażenie przenoszone jest drogą kropelkową. Chorują głównie dzieci w wieku od 3 miesięcy do 3 lat. Zakażenie jest w większości przypadków wywoływane przez Haemophilus influenzae typu b. Choroba może przebiegać pod różnymi postaciami klinicznymi, np. jako zapalenie ucha środkowego, krtani, kości, stawów, osierdzia, czy też jako ropne zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych.

104 Legionella pneumophila - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Legionella pneumophila. Naturalnym rezerwuarem tych bakterii są zeutrofizowane wody powierzchniowe lub wilgotna gleba. Bakterie te kolonizują także sieć wodociągową, wodne urządzenia kąpielowe (prysznice, wanny, baseny) oraz klimatyzatory. Wywołują zakażenia układu oddechowego (za pośrednictwem aerozoli wytwarzanych w urządzeniach klimatyzacyjnych, prysznicach, saunach, itp.), które mogą przebiegać epidemicznie. U chorego bakterie wydalane są z plwociną, nie stwierdzono jednak przenoszenia zakażenia z człowieka na człowieka. Rodzaj Legionella obejmuje 49 gatunków, 80-90% zachorowań spowodowanych jest infekcją Legionella pneumophila. Legionelloza może występować pod kilkoma postaciami:

-choroba legionistów - postać z dominującymi objawami ciężkiego zapalenia płuc;

-gorączka Pontiac - postać pozapłucna, łagodna, grypopodobna;

-postać pozapłucna - ciężka, uogólniona, stan septyczny u chorych, m.in. po transplantacji nerek lub serca.

105 Mycobacterium tuberculosis (gruźlica) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA prątka gruźlicy (Mycobacterium tuberculosis). Szacuje się, że ok. 1/3 populacji świata jest zainfekowana tą bakterią. W Polsce wskaźnik zapadalności na gruźlicę wynosi 24,9/100 tys. Jest to choroba wysoko zakaźna, która przenosi się drogą kropelkową. Gruźlica zwykle atakuje płuca, ale może rozwinąć się również w każdym innym narządzie i tkance ustroju. Typowymi objawami infekcji czynnej M. tuberculosis są: kaszel, krwioplucie, popołudniowa gorączka, nocne poty i spadek masy ciała. Zachorowaniu sprzyja obniżona odporność, choroby takie jak cukrzyca, pylica czy niedożywienie. Tradycyjna diagnostyka prątków gruźlicy oparta jest na długotrwałej (3 - 6 tygodni) hodowli szczepów M. tuberculosis, co znacznie wydłuża czas uzyskania diagnozy i opóźnia rozpoczęcie prawidłowego leczenia. Testy molekularne oparte na wykrywaniu DNA bakterii, pozwalają na znaczne skrócenie czasu potrzebnego na diagnostykę gruźlicy. Wiąże się to z możliwością szybkiego rozpoczęcia leczenia, a także uniknięcia wielonarządowych zmian chorobowych oraz zarażenia kolejnych osób.

108 Mycoplasma pneumoniae, jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Mycoplasma pneumoniae wywołującej mykoplazmozę. Objawy choroby są zróżnicowane, od lekkiego zakażenia górnych dróg oddechowych do ostrego zapalenia płuc, ponadto mogą jej towarzyszyć powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów, albo trzustki, częste są objawy skórne w postaci wysypek, rumieni, wrzodziejącego zapalenia jamy ustnej czy zapalenia spojówek. Przebieg zakażenia mykoplazmatycznego u 10-20% osób może być bezobjawowy. W 60-80% przypadków przebiega jako zakażenie górnych dróg oddechowych lub zapalenie tchawicy i oskrzeli. W niektórych przypadkach może pojawić się zapalnie płuc lub powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów i trzustki. Typowymi objawami infekcji jest niewielki wzrost temperatury, katar, bóle głowy i gardła, przewlekły, suchy kaszel. Do infekcji M. pneumoniae dochodzi głównie drogą kropelkową, jednak patogen ten jest również jedną z koinfekcji przenoszonych przez kleszcze.

318 AdV (Adenowirus) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA adenowirusów (AdV). Dotychczas rozpoznano 49 serotypów adenowirusów, podzielonych na 6 grup od A do F. Wirusy te wywołują głównie infekcje układu oddechowego i oczu, w tym infekcje dróg oddechowych u dzieci, zakażenie oddechowe rekrutów (występuje w dużych zbiorowiskach ludzi), czy tzw. oko stoczniowca (choroba przenoszona m.inn. za pomocą niesterylnych narzędzi medycznych).

319 MPV (Metapneumowirus) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA wirusa MPV w wymazach z jamy nosowo-gardłowej. Metapneumowirus został zidentyfikowany po raz pierwszy w 2001 roku u dzieci z infekcją dróg oddechowych. Wirus ten odpowiada za około 12% przypadków ciężkich chorób układu oddechowego (zapalenia płuc, zapalenia oskrzelików) i 15 % przeziębień u dzieci. Objawy zakażenia wirusem MPV u dzieci są bardzo zbliżone do objawów towarzyszących infekcjom wywołanych przez wirusa RSV, który głównie wywołuje infekcje dolnych dróg oddechowych u dzieci. Metapneumowirus powoduje szerokie spektrum objawów klinicznych, od łagodnych przeziębień po ciężkie zapalenia oskrzelików. Występuje na całym świecie, atakuje sezonowo, ze szczytem zachorowań w zimie.

320 Coronawirus 229E - jakościowo, PCR

Test polega na wykryciu obecności RNA Coronawirusa 229E w wymazach z jamy nosowo-gardłowej. Wirus tenatakuje górne drogi oddechowe oraz układ pokarmowy. Przyjmuje się, że coronawirusy są odpowiedzialne są za ok. 1/3 zakażeń górnych dróg oddechowych, powodując powszechne u osób dorosłych przeziębienia, występujące ze szczególnym nasileniem w okresie zimowym i wczesną wiosną. Znanych jest 5 typów coronawirusów, z pośród których 4 zdolne są do zakażania ludzi. Wśród coronawirusów znajdują się też czynniki zakaźne wywołujące ciężki ostry zespół oddechowy (SARS).

321 Coronawirus OC43 - jakościowo, PCR

Test polega na wykryciu obecności RNA Coronawirusa OC43 w wymazach z jamy nosowo-gardłowej. Wirus tenatakuje górne drogi oddechowe oraz układ pokarmowy. Przyjmuje się, że coronawirusy są odpowiedzialne są za ok. 1/3 zakażeń górnych dróg oddechowych, powodując powszechne u osób dorosłych przeziębienia, występujące ze szczególnym nasileniem w okresie zimowym i wczesną wiosną. Znanych jest 5 typów coronawirusów, z pośród których 4 zdolne są do zakażania ludzi. Wśród coronawirusów znajdują się też czynniki zakaźne wywołujące ciężki ostry zespół oddechowy (SARS).

322 PIV 1 (wirus paragypy typu 1) - jakościowo, PCR

Test pozwala na wykrycie obecności RNA wirusa paragrypy typu 1 PIV1 w wymazie z jamy nosowo-gardłowej. Wrusy PIV (paragrypy, grypy rzekomej) reprezentowane są przez 4 serotypy onaczane: 1, 2, 3, 4. Typy 1 i 2 są przyczyną jesiennych infekcji, natomiast typ 3 odpowiada za coroczne epidemie wiosenne. Wirusy paragrypy są przyczyną 5 - 20% infekcji dróg oddechowych u dzieci i ok. 5% u dorosłych. Okres wylęgania choroby wynosi 3 - 6 dni. Wirus PIV1 odpowiada za występowanie zespołu krupu u dzieci w wieku 2-4 lat. U osób dorosłych infekcja przebiega jako przeziębienie i chrypka.

323 PIV 2 (wirus paragypy typu 2) - jakościowo, PCR

Test pozwala na wykrycie obecności RNA wirusa paragrypy typu 2 PIV2 w wymazie z jamy nosowo-gardłowej. Wrusy PIV (paragrypy, grypy rzekomej) reprezentowane są przez 4 serotypy oznaczane 1, 2, 3, 4. Typy 1 i 2 są przyczyną jesiennych infekcji, natomiast typ 3 odpowiada za coroczne epidemie wiosenne. Wirusy paragrypy są przyczyną 5 - 20% infekcji dróg oddechowych u dzieci i ok. 5% u dorosłych. Okres wylęgania choroby wynosi 3 - 6 dni. Wirus PIV2 powoduje objawy podobne do zespołu krupu, lecz z łagodniejszym przebiegiem choroby.

324 PIV 3 (wirus paragypy typu 3) - jakościowo, PCR

Test pozwala na wykrycie obecności RNA wirusa paragrypy typu 3 PIV3 w wymazie z jamy nosowo-gardłowej. Wrusy PIV (paragrypy, grypy rzekomej) reprezentowane są przez 4 serotypy oznaczane 1, 2, 3, 4. Typy 1 i 2 są przyczyną jesiennych infekcji, natomiast typ 3 odpowiada za coroczne epidemie wiosenne. Wirusy paragrypy są przyczyną 5 - 20% infekcji dróg oddechowych u dzieci i ok. 5% u dorosłych. Okres wylęgania choroby wynosi 3 - 6 dni. Wirus PIV3 odpowiedzialny jest głównie za występowanie zapalenia płuc u niemowląt.

325 Wirus grypy typu A (Flu A virus) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA wirusa grypy typu A. Wirus grypy występuje w 3 odmianach: A, B i C. Jednoniciowy RNA wirusa posiada 8 segmentów, co jest rzadko spotykane wśród wirusów i wiąże się ze znaczną częstością występowania mutacji, stąd ogromna różnorodność podtypów tego wirusa. Wirus grypy A atakuje ludzi i zwierzęta (ptaki, świnie). Przebieg choroby jest ciężki i cztery razy częściej niż w przypadku grypy typu B kończy się hospitalizacją. Grypa typu A najczęściej pojawia się w postaci epidemii, co 10-30 lat pojawia się natomiast pandemia grypy typu A. Co roku grypa jest przyczyną ok. 30 tys. zgonów na świecie. Niebezpieczeństwo grypy wynika także z jej powikłań, na które szczególnie narażone są osoby starsze, małe dzieci, osoby przewlekle chore, o obniżonej odporności oraz kobiety w ciąży. Do najczęstszych konsekwencji chorobowych zalicza się: zapalenie oskrzeli, płuc i mięśnia sercowego.

326 Wirus grypy typu B (Flu B virus) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA wirusa grypy typu B. Wirus ten infekuje wyłącznie ludzi. Podobnie jak wirus grypy A posiada jednoniciowy RNA złożony z 8 segmentów lecz charakteryzuje się mniejszą niż on zmiennością. Grypa jest przenoszona drogą kropelkową: drobinki śliny są rozpylane podczas kaszlu lub kichania. Do podstawowych jej objawów należą: wysoka temperatura, często powyżej 39°C do 40°C, dreszcze, bóle głowy i bóle mięśni. Nieleczona grypa prowadzi do groźnych powikłań, na które szczególnie narażone są osoby starsze, małe dzieci, osoby przewlekle chore, o obniżonej odporności oraz kobiety w ciąży. Do najczęstszych zalicza się: zapalenie oskrzeli, płuc i mięśnia sercowego.

327 RSVB (Respiratory Syncytial Virus B) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA wirusa RSVB. Wirusy RSV są jedną z przyczyn chorób dolnych dróg oddechowych u małych dzieci i niemowląt. Wyróżnia się 2 typy antygenowe wirusa (A i B), w obrębie których istnieją bardzo liczne serotypy. Wirus RSV typu B odpowiedzialny jest za rozwój łagodnych infekcji układu oddechowego, dotykających wszystkich ludzi. Do zachorowań dochodzi na całym świecie w klimacie umiarkowanym, najczęściej zimą. Objawy infekcji, to katar, ból gardła, kaszel. U osób osłabionych lub starszych może dojść do rozwoju zapalenia płuc.

328 RSVA (Respiratory Syncytial Virus A) - jakościowo, PCR

Badanie polega na wykrywaniu obecności RNA wirusa RSVA w badanym materiale. Wirusy RSV są jedną z głównych przyczyn chorób dolnych dróg oddechowych u małych dzieci i niemowląt. Wyróżnia się 2 typy antygenowe wirusa (A i B), w obrębie których istnieją bardzo liczne serotypy. Najbardziej narażone na infekcje typem A są małe dzieci i niemowlęta, u których dochodzi do rozwoju ciężkich infekcji układu oddechowego. Większość dzieci ulega zakażeniu przynajmniej jeden raz przed ukończeniem 2 roku życia. Infekcja prowadzi do rozwoju zapalenia oskrzelików, zapalenia płuc i pojawienia się problemów z oddychaniem, najczęściej kończy się hospitalizacją.

329 Wirus Rhino (Rhino virus 1) - jakościowo, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA Rhinowirusa 1. Rhinowirusy są częstym czynnikiem zakaźnym, który jest odpowiedzialny za około 30% przypadków powszechnej u ludzi choroby, jaką jest przeziębienie. Czasem jednak, szczególnie u niemowląt, mogą prowadzić do cięższych schorzeń takich jak zapalenie oskrzelików lub płuc. Dotychczas nie opracowano skutecznej szczepionki na Rhinowirusy, co wynika z ogromnej ilości jego szczepów i serotypów.

722 Panel ODDECHOWY - identyfikacja 3 bakterii, jakościowo, Real-Time PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności DNA i identyfikacji gatunkowej 3 bakterii wywołujących infekcje dróg oddechowych, tj: Streptococcus pneumoniae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae. Test umożliwia identyfikację patogenu sprawczego infekcji dróg oddechowych o etiologii bakteryjnej. Wykrywane patogeny są częstą przyczyną atypowego zapalenia płuc u dzieci, oporne na tradycyjną antybiotykoterapię.

712 Panel PNEUMO-BACTER 6 - identyfikacja 6 bakterii, jakościowo, multiplex PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności DNA i identyfikacji gatunkowej 6 bakterii wywołujących infekcje dróg oddechowych, tj: Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, Mycoplasma pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae, Legionella pneumophila i Bordatella pertussis. Test umożliwia identyfikację patogena sprawczego infekcji dróg oddechowych o etiologii bakteryjnej.

713 Panel PNEUMO-VIRUS 12 - identyfikacja 12 wirusów, jakościowo, multiplex PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności materiału genetycznego i identyfikacji 12 wirusów wywołujących infekcje dróg oddechowych, tj: AdV, MPV, Coronavirus 229E, PIV1, PIV2, PIV3, grypa typu A, grypa typu B, RSVB, RSVA, Rhino wirus i Coronavirus OC43. Test umożliwia identyfikację patogena sprawczego infekcji dróg oddechowych o etiologii wirusowej.

714 Panel PNEUMO-TOTAL 18 - identyfikacja 13 wirusów i 5 bakterii, multiplex PCR z rozdziałem w wysokiej rozdzielczości

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności materiału genetycznego i identyfikacji 18 patogenów wywołujących infekcje dróg oddechowych, w tym: 13wirusów: wirus grypy A, wirus grypy B, RSVA, RSVB, Rhinovirus, Coronavirus OC43/HKU1, Coronavirus 229E/NL63, Adenovirus, wirus paragrypy 1, wirus paragrypy 2, wirus paragrypy 3, bocawirus i enterowirus) i 5 bakterii: Mycoplasma pneumoniae, Haemophilus influenzae, Streptococcus pneumoniae, Chlamydophila pneumoniae i Legionella pneumophila. Test umożliwia identyfikację patogenów sprawczych infekcji dróg oddechowych zarówno o etiologii wirusowej jak i bakteryjnej oraz ich rozróżnienie.