Centrum Badań DNA

332 Wirus CMV - jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA wirusa CMV (Human Cytomegalovirus). CMV jest wirusem z rodziny ludzkich wirusów herpes. Dla większości zdrowych ludzi infekcje CMV są niegroźne i nie manifestują się uciążliwymi objawami, ani żadnymi długoterminowymi konsekwencjami dla zdrowia. Sporadycznie mogą występować objawy infekcji w postaci mononukleozy, przedłużonej gorączki, czy łagodnego zapalenia wątroby. Zakażenie CMV może być jednak bardzo groźne dla pewnych grup ryzyka, do których należą infekcje płodu w czasie ciąży oraz infekcje u osób z upośledzoną odpornością, takich jak biorcy organów i zakażeni wirusem HIV. Cytomegalia jest głównym czynnikiem sprawczym zakażeń wrodzonych, a także najczęstszą spośród zakaźnych przyczyn upośledzeń umysłowych i głuchoty, może także być odpowiedzialna za opóźnienie rozwoju ruchowego dziecka. Nierozpoznane zakażenie wirusem z kontaktu okołoporodowego może tlić się bezobjawowo na terenie narządu słuchu, upośledzając go nawet do głuchoty. Wczesne wykrycie zakażenia CMV związane jest z wprowadzeniem odpowiedniej profilaktyki u osób z grupy ryzyka, w tym szczególnie u kobiet w ciąży i dzieci z podejrzeniem kontaktu okołoporodowego. Tym bardziej, że rozprzestrzenianie się wirusa może mieć miejsce bez jakichkolwiek wykrywalnych oznak i bez występujących objawów. Test diagnostyczny daje możliwość bardzo czułego, szybkiego i specyficznego wykrywania zakażeń wirusem CMV.

333 Wirus CMV - jakościowo + ilościowo, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 332 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii DNA wirusa CMV. Test umożliwia określenia ilości wirusa we krwi, co pozwala oszacować stan wiremii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

316 Wirus HSV I/II - jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA wirusa HSV-I i HSV-II. Wyróżnia się dwa typy wirusów opryszczki pospolitej: HSV-1 (opryszczka wargowa), HSV-2 (opryszczka narządów płciowych). Opryszczka wargowa ujawnia się w postaci powierzchownych zapalnych pęcherzyków uformowanych w skupiska, na granicy błony śluzowej jamy ustnej i warg. Pierwotne zakażenie występuje najczęściej u dzieci w postaci tzw. opryszczkowego zapalenia jamy ustnej, przebiegającego z wysoką gorączką i ciężkimi objawami ogólnymi, jak posocznica, zapalenie mózgu. Opryszczkowe zapalenie mózgu jest chorobą niezwykle groźną, która gdy nie jest leczona może powodować trwałe schorzenia neurologiczne lub kończy się śmiercią. Opryszczka narządów płciowych (herpes genitalis) wywoływana jest przez wirus HSV2. Do zakażenia dochodzi zwykle w wieku dorosłym poprzez kontakt seksualny (jedna z chorób przenoszonych drogą płciową). U kobiet zmiany chorobowe pojawiają się na wargach sromowych, pochwie, kroczu, czasami na wewnętrznej powierzchni ud a także na szyjce macicy. Uważa się, że zakażenie HSV2 u kobiet zwiększa ryzyko wystąpienia raka szyjki macicy, ale nie stanowi samodzielnego czynnika etiologicznego.

317 Wirus HSV I/II - jakościowo + ilościowo, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 316 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii DNA wirusa HSV-1 i HSV-2. Test umożliwia określenia ilości wirusa we krwi, co pozwala oszacować stan wiremii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

334 Poliomawirusy JC/BK - jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA wirusów JCV i BKV. Oba wirusy wyizolowano po raz pierwszy w 1971 roku od osób o inicjałach, z których utworzono nazwy tych patogenów (JC i BK). Wirus BK został wyizolowany z moczu pacjenta po przeszczepie nerki, natomiast wirusa JC po raz pierwszy znaleziono w tkance mózgowej pacjenta chorującego na chłoniaka Hodgkina i postępującą wieloogniskową leukoencefalopatię. Wirusy JC i BK są rozpowszechnione na całym świecie, jednak do dziś nie poznano dokładnie ich dróg zakażenia. Pierwotne zakażenie poliomawirusowe jest zwykle bezobjawowe i w związku z tym bardzo trudne do wykrycia, zwłaszcza, że po infekcji wirusy mogą przebywać w organizmie w stanie latencji przez wiele lat. Do wtórnych infekcji dochodzi podczas obniżenia odporności u osoby zainfekowanej, np. w czasie ciąży, po transplantacji lub u osób chorych na AIDS.
Wirus JCV wywołuje postępującą wieloogniskową leukoencefalopatię (progressive multifocal leukoencephalopathy - PML). Jest to rzadka choroba demielinizacyjna mózgu. Aktywacja latentnego JCV prowadzi do uszkodzenia funkcji i zmniejszenia liczby limfocytów T-helper. Choroba niszczy istotę białą mózgu. Zwykle tworzy wiele rozsianych ognisk demielinizacyjnych, doprowadzając do zgonu w krótkim czasie. Na zachorowania narażeni są głównie chorzy na AIDS oraz choroby limfoproliferacyjne. Wirus BKV może wywoływać krwotoczne zapalenia pęcherza, a także zwężenie moczowodu (stenoza moczowodu), zwłaszcza u pacjentów po przeszczepie szpiku kostnego. Zapalenie takie przebiega zwykle z silnym krwiomoczem i wysoką gorączką. Zarówno wirus JCV jak i BKV mogą wywoływać komplikacje u pacjentów po transplantacji nerek. Częstym powikłaniem jest zwężenie (stenoza) moczowodu.

335 Poliomawirusy JC/BK - jakościowo + ilościowo, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 334 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii DNA wirusa JCV i BKV. Test umożliwia określenia ilości wirusów we krwi, co pozwala oszacować stan wiremii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

336 Enterowirusy - jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności RNA enterowirusów. Enterowirusy to grupa wirusów należąca do rodziny Picornaviridae, zbudowanych z jednoniciowego RNA ((+)ssRNA), które są częstą przyczyną chorób u ludzi, w tym zwłaszcza u dzieci. Infekcje enterowirusowe są wywoływane przez 23 wirusy Coxsackie A, 6 wirusów Coxsackie B, 28 echovirusów i 5 niesklasyfikowanych enterowirusów. Choroby wywoływane w wyniku zakażeń enterowirusowych są bardzo różnorodne, np.: choroba rąk, stóp i ust (wirus Coxsackie), angina opryszczkowa (wirus Coxsackie, wirus HSV-1), zapalenie mięśnia sercowego czy choroba bornholmska (pleurodynia). Objawy infekcji enterowirusowych u pacjentów mogą być również bardzo różnorodne, od łagodnych objawów grypopodobnych, aż po tak poważne jak zapalenie mięśnia sercowego, zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych czy sepsa u noworodków.

337 Enterowirusy - jakościowo + ilościowo, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 336 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii RNA enterowirusow. Test umożliwia określenie ilości wirusów w badanym materiale, co pozwala oszacować stan wiremii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

140 Acinetobacter baumanii - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Acinetobacter baumanii . Jest to rozpowszechniona bakteria wywołująca oportunistyczne infekcje u ludzi, której rezerwuarem jest gleba i woda. Bakteria ta jest częsta przyczyną zakażeń wewnątrzszpitalnych zwłaszcza w przypadku pacjentów wymagających dużej ilości procedur inwazyjnych, przebywających na Oddziałach Intensywnej Terapii. Zakażenie u takich pacjentów może często prowadzić do sepsy.

103 Bartonella henselae, jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Bartonella henselae, przenoszonej na człowieka głównie przez stawonogi odżywiające się krwią ssaków (hematofagi), np.: kleszcze, wszy czy pchły. Zarazić się nią można również w wyniku zadrapania lub ugryzienia przez zakażone zwierzę, najczęściej kota lub psa (stąd ang. nazwa choroby „cat scratch disease", tj. choroba kociego pazura). Bartonella henselae jest wewnątrzkomórkowym pasożytem przebywającym w erytrocytach. U ludzi choroba początkowo przebiega bezobjawowo lub tylko z objawami miejscowymi w miejscu zranienia (miejscowe zaczerwienienie, grudka zapalna). U części osób, po kilku tygodniach od infekcji pojawia się gorączka, powiększenie węzłów chłonnych, mogących ulegać rozmiękaniu i przebiciu; ewentualnie inne objawy chorobowe (bóle głowy, pleców, podbrzusza, zmęczenie). Nieleczone zakażenie jest przyczyną powracających gorączek oraz może prowadzić do zapalenia mózgu lub serca.

113 Chlamydia trachomatis - test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Chlamydia trachomatis we krwi i wymazach z dróg moczowo-płciowych. Bakteria ta najczęściej rozprzestrzenia się drogą płciową. Nieleczona może być przyczyną stanów zapalnych szyjki macicy i cewki moczowej. Zakażenie może prowadzić również do niepłodności, a także poronień lub wad rozwojowych płodu u kobiet ciężarnych. Infekcja może zostać przeniesiona na dziecko w trakcie porodu i wywołać groźne zapalenia płuc lub spojówek u noworodków. Chlamydię trachomatis uważa się także za jedną z przyczyn rozwoju raka szyjki macicy. Zakażenie w większym stopniu dotyka kobiet i często ma charakter bezobjawowy, przez co wiele osób nie jest świadomych, że może być jej nosicielem.
Chlamydia trachomatis może również powodować zapalenia stawów, które są objawowo podobne do zapalenia stawów w boreliozie. Bakteria ta może współwystępować z bakteriami z rodzaju Borrelia powodując infekcje złożone.

137 Enterobacter aerogenes - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Enterobacter aerogenes. E. aerogenes jest tlenową pałeczką Gram(-) z rodziny Enterobacteriaceae. Bakteria ta jest częstym czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych. Infekcje mogą prowadzić do zapalenia płuc, zakażenia układu moczowego, posocznicy, zakażenia ran czy zapalenia opon mózgowo - rdzeniowych.

135 Enterobacter cloacae - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Enterobacter cloacae . E. cloacae jest tlenową pałeczką Gram(-) z rodziny Enterobacteriaceae. Bakteria ta może wchodzić w skład flory fizjologicznej przewodu pokarmowego (nosicielstwo 40-60%). Jest też częstym czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych. Infekcje mogą prowadzić do zapalenia płuc, zakażenia układu moczowego, posocznicy czy zapalenia opon mózgowo - rdzeniowych.

136 Enterococcus faecium/faecalis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Enterococcus faecium i Enterococcus faecalis. Są to Gram(+) bakterie, które wchodzą w skład flory przewodu pokarmowego i pochwy. Oportunistyczne infekcje enterokokowe mogą prowadzić do: zakażenia dróg moczowych, zapalenia gruczołu krokowego, zapalenia wsierdzia, bakteriemia (np.: cewnikowanie lub inwazyjne zabiegi na drogach moczowych), zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych, zakażenia w obrębie jamy brzusznej (np.: zapalenie dróg żółciowych, otrzewnej), zakażenia skóry i tkanek miękkich (np.: zakażenia ran chirurgicznych, oparzeniowych), zakażenia kości i stawów zapalenia płuc, czy zapalenia błony śluzowej macicy. Ogromnym problemem w leczeniu infekcji enterokokowych jest ich znaczna i narastająca oporność na wiele antybiotyków.

143 Escherichia coli - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA pałeczki okrężnicy ( Escherichia coli ). Jest to tlenowa pałeczka Gram(-) z rodziny Enterobacteriaceae. Wchodzi w skład flory przewodu pokarmowego. Jest drobnoustrojem oportunistycznym - może wywoływać zakażenia egzogenne i endogenne niemal każdego narządu lub tkanki. Jest najczęstszym czynnikiem etiologicznym zakażeń układu moczowego i przewodu pokarmowego. Ponadto E. coli może wywoływać posocznicę, wstrząs endotoksyczny, zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych u noworodków, szpitalne zapalenie płuc oraz zakażenia ran.

134 Klebsiella oxytoca - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Klebsiella oxytoca. Jest to tlenowa pałeczka Gram(-) z rodziny Enterobacteriaceae. Jest częstym czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych jak i pozaszpitalnych. Może wywoływać zapalenie płuc, zakażenia układu moczowego, posocznicę, zakażenia ran, zakażenia dróg żółciowych, czy zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych.

139 Klebsiella pneumoniae - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Klebsiella pneumoniae . Jest to tlenowa pałeczka Gram(-) z rodziny Enterobacteriaceae. Bakteria ta jest blisko spokrewniona z pałeczką Klebsiella oxytoca i podobnie jak ona jest częstym czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych jak i pozaszpitalnych. Może wywoływać zapalenie płuc, zakażenia układu moczowego, posocznicę, zakażenia ran, zakażenia dróg żółciowych, czy zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych.

108 Mycoplasma pneumoniae, jakościowo, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Mycoplasma pneumoniae wywołującej mykoplazmozę. Objawy choroby są zróżnicowane, od lekkiego zakażenia górnych dróg oddechowych do ostrego zapalenia płuc, ponadto mogą jej towarzyszyć powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów, albo trzustki, częste są objawy skórne w postaci wysypek, rumieni, wrzodziejącego zapalenia jamy ustnej czy zapalenia spojówek. Przebieg zakażenia mykoplazmatycznego u 10-20% osób może być bezobjawowy. W 60-80% przypadków przebiega jako zakażenie górnych dróg oddechowych lub zapalenie tchawicy i oskrzeli. W niektórych przypadkach może pojawić się zapalnie płuc lub powikłania ze strony układu nerwowego, serca, stawów i trzustki. Typowymi objawami infekcji jest niewielki wzrost temperatury, katar, bóle głowy i gardła, przewlekły, suchy kaszel. Do infekcji M. pneumoniae dochodzi głównie drogą kropelkową, jednak patogen ten jest również jedną z koinfekcji przenoszonych przez kleszcze.

109 Mycoplasma pneumoniae, jakościowo + ilościowo, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 108 i polega na wykrywaniu obecności wraz z oznaczeniem ilości kopii genomowego DNA bakterii Mycoplasma pneumoniae wywołującej mykoplazmozę. Umożliwia to monitorowanie zmian ilości bakterii w organizmie w trakcie choroby i leczenia.

125 Neisseria meningitidis (meningokoki)- test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA dwoinki zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych ( Neisseria meningitidis ). Neisseria meningitidis jest bardzo zjadliwą bakterią Gram(-). Rezerwuarem tej bakterii w organizmie człowieka są górne drogi oddechowe (jama nosowo-gardłowa, 10-20% zdrowych osób). Inwazja dwoinki na układ krwionośny powoduje całe spektrum chorób, od łagodnej i krótkotrwałej bakteriemii, aż po gwałtowną infekcję ogólnoustrojową, która szybko kończy się zgonem osoby zarażonej. Głównym objawem menigokokemii jest zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych. W rzadszych przypadkach możliwe są również inne objawy, związane z infekcją innych organów, takich jak osierdzie, stawy czy oczy. Meningokoki są przenoszone drogą kropelkowa lub poprzez bezpośredni kontakt z osobą zakażoną. W pierwszej kolejności dochodzi do asymptomatycznego zakażenia górnych dróg oddechowych, które w większości przypadków jest przejściowe i ustępuje w ciągu kilku tygodni. W sporadycznych przypadkach może jednak dojść do przedostania się bakterii do układu krążenia i rozwoju choroby.

126 Neisseria meningitidis - test jakościowy + ilościowy, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 125 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii DNA dwoinki zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych ( Neisseria meningitidis ). Możliwość określenia ilości bakterii we krwi, pozwala oszacować stan bakteriemii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

142 Proteus mirabilis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA pałeczki odmieńca ( Proteus mirabilis ). Proteus mirabilis jest Gram(-) pałeczką tlenową z rodziny Enterobacteriaceae. Jest naturalnym składnikiem mikroflory bakteryjnej przewodu pokarmowego. Bakteria ta może wywoływać zakażenia (endo- i egzogenne), atakując zwykle w pierwszej kolejności układ moczowo-płciowy. W dalszej kolejności może dojść do infekcji ogólnoustrojowej.

144 Pseudomonas aeruginosa - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA pałeczki ropy błękitnej ( Pseudomonas aeruginosa ). Pseudomonas aeruginosa jest Gram(-) pałeczką tlenową, bytującą w środowisku wilgotnym (woda, gleba, powierzchnia roślin). Cechą charakterystyczną tej bakterii jest zdolność do wytwarzania barwników. Jest ona bardzo niebezpiecznym patogenem chorobotwórczym dla osób o obniżonej odporności organizmu oraz jednym z najgroźniejszych mikroorganizmów wywołujących zakażenia szpitalne. Posiada bardzo szerokie spektrum zdolności chorobotwórczych wywołując między innymi zakażenia ran, zapalenie płuc i dróg oddechowych, bakteriemię, posocznicę, zakażenia wewnątrzbrzuszne (po zabiegach chirurgicznych), zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych, ropień mózgu, zapalenie wsierdzia, zakażenia układu moczowego, kości i stawów, zapalenie ucha zewnętrznego, czy też zakażenia gałki ocznej (szkła kontaktowe, zanieczyszczone krople do oczu). Leczenie zakażenia Pseudomonas aeruginosa może być bardzo trudne z uwagi na znaczną oporność tej bakterii na antybiotyki.

138 Serratia marcescens - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA pałeczki krwawej (Serratia marcescens). Serratia marcescens jest Gram(-) pałeczką tlenową z rodziny Enterobacteriaceae. Jej polska nazwa wynika ze zdolności niektórych szczepów do wytwarzania czerwonego barwnika (prodigozyny). Bakteria ta jest typowym patogenem oportunistycznym człowieka, ponieważ jest chorobotwórcza wyłącznie dla pacjentów o osłabionej odporności. Z uwagi na znaczną odporność tej bakterii na dezynfekcję, stanowi ona częstą przyczynę zakażeń szpitalnych. Serratia marcescens może wywoływać zapalenie płuc, zakażenia układu moczowego, posocznicę, zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych, zakażenia gałki ocznej i przewodu pokarmowego.

129 Staphylococcus aureus - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA gronkowca złocistego (Staphylococcus aureus). Staphylococcus aureus jest Gram(+) bakterią, która może występować na powierzchni skóry człowieka oraz w jamie nosowo-gardłowej. Część populacji ludzkiej (10 do 50%) stale lub okresowo jest nosicielami tych bakterii bez wystąpienia objawów chorobowych. Nosicielstwo jest szczególnie powszechne wśród pracowników służby zdrowia, co ma istotne znaczenie dla powstawania zakażeń wewnątrzszpitalnych spowodowanych tym patogenem. Gronkowiec złocisty powoduje zakażenia ropne skóry, ran chirurgicznych, szpitalne zapalenie płuc, bakteriemię, zapalenie wsierdzia, zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych, zapalenie kości i szpiku (osteomyelitis), ropnie narządowe: płuc, wątroby, nerek, mózgu i piersi u kobiet karmiących. Bardzo niebezpieczne dla zdrowia ludzi są również toksyny gronkowca złocistego, odporne na działanie wysokich temperatur, wytwarzane w zainfekowanych produktach spożywczych.

128 Staphylococcus epidermidis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA gronkowca skórnego (Staphylococcus epidermidis). Staphylococcus epidermidis jest Gram(+) bakterią, która jest naturalnym składnikiem mikroflory bakteryjnej skóry człowieka. Powszechnie występuje również na błonach śluzowych jamy ustnej, nosa i gardła, w drogach moczowo-płciowych, czy w jelicie grubym. Gronkowiec skórny nie wywołuje infekcji u ludzi zdrowych, jednak może być bardzo niebezpiecznym patogenem dla osób z niedoborami odporności (nowotwory, neutropenia, choroby serca, urazy i oparzenia, przeszczepy narządów i szpiku, wcześniactwo itp.) lub z ciałem obcym (protezy, sztuczne zastawki, cewniki naczyniowe, otrzewnowe itp.). Staphylococcus epidermidis może powodować bakteriemię, zapalenie wsierdzia, zapalenie otrzewnej, posocznicę, zapalenie opon mózgowo - rdzeniowych, zapalenie kości i szpiku (osteomyelitis), czy zakażenie układu moczowego. Z uwagi na powszechne występowanie tej bakterii na powierzchni skóry wynik pozytywny testu może świadczyć o błędnym pobraniu materiału z powodu niedostatecznego odkażenia miejsca nakłucia. Niemniej jednak bakteria ta może być czynnikiem etiologicznym sepsy i nawet jednokrotnego dodatniego wyniku nie należy lekceważyć, zwłaszcza przy braku stwierdzenia innych patogenów.

127 Staphylococcus haemolyticus - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA gronkowca Staphylococcus haemolyticus. Staphylococcus haemolyticus jest Gram(+) bakterią, która jest naturalnym składnikiem mikroflory bakteryjnej skóry człowieka. Gronkowiec ten nie wywołuje infekcji u ludzi zdrowych, jednak może być bardzo niebezpiecznym patogenem dla osób z niedoborami odporności. Bakteria ta może wywoływać zapalenie opon mózgowo-rdzeniowych, bakteriemię, zapalenia skóry i tkanek miękkich, czy zapalenia stawów (zwłaszcza w przypadku obecności protez). Leczenie zakażeń wywołanych przez S. haemolyticus może być bardzo trudne z uwagina znaczną oporność tej bakterii na antybiotyki.

130 Staphylococcus spp. - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA 22 gatunków gronkowców z rodzaju Staphylococcus, tj.: S. aureus, S. epidermidis, S. haemolyticus, S. pasteuri, S. warneri, S. cohnii subsp. urealyticum, S. hominis subsp. hominis, S. caprae, S. xylosus, S. equorum, S. simulans, S. arlettae, S. kloosii, S. gallinarum, S. auricularis, S. chromogenenes, S. delphini, S. intermedium, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. lugdunensis, S. capitis subsp. ureplyticus, S. schleiferi subspp. Scheleiferi. Test nie umożliwia jednak identyfikacji gatunku gronkowca obecnego w badanym materiale. Jeśli istnieje konieczność identyfikacji gatunkowej należy wykonać test numer 717, który umożliwia wykrycie tych samych gatunków gronkowców wraz z jednoczesną identyfikację gatunkową S. aureus, S. epidermidis i S. haemolyticus.

141 Stenotrophomonas maltophilia - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA Stenotrophomonas maltophilia. Stenotrophomonas maltophilia jest pałeczką Gram(-), wywołującą zakażenia wewnątrz szpitalne u osób z niedoborami odporności (chorzy na AIDS, ciężka choroba podstawowa, stan po przeszczepie). Infekcje S. maltophilia są częstsze u osób podlegających dłuższej hospitalizacji, w stosunku do których stosowano rurki intubacyjne, cewniki, czy oddychanie za pomocą respiratora. Są naturalnie odporne na wiele antybiotyków. Bakteria ta może wywoływać zapalenie płuc, bakteriemię, jak również posocznicę.

145 Streptococcus agalactiae - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA paciorkowca Streptococcus agalactiae. Streptococcus agalactiae jest Gram(+) paciorkowcem grupy B. Występuje bardzo często w przewodzie pokarmowym i układzie moczowo-płciowym osób dorosłych (>50%). Bakteria te jest bardzo niebezpiecznym czynnikiem etiologicznym zakażeń u noworodków oraz osób o obniżonej odporności. S. agalactiae jest również częsta przyczyną infekcji u kobiet po porodzie - od zapalenia kosmówki i błony śluzowej macicy, po poważniejsze zakażenia ogólnoustrojowe z posocznicą włącznie.

131 Streptococcus mitis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA paciorkowca Streptococcus mitis. Streptococcus mitis jest Gram(+) paciorkowcem. Występuje powszechnie w jamie ustnej, gardle i jamie nosowo-gardłowej ludzi. Może być niebezpiecznym patogenem u osób z obniżoną odpornością, wywołując między innymi zapalenie wsierdzia.

106 Streptococcus pneumoniae - test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA dwoinki zapalenia płuc ( Streptococcus pneumoniae ), popularnie zwanej pneumokokiem. Streptococcus pneumoniae jest Gram(+) paciorkowcem, który wywołuje zakażenia górnych i dolnych dróg oddechowych, mogą prowadzić do zapalenia płuc, posocznicy czy też groźnego zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych. Zakażenia pneumokokowe w sposób szczególny zagrażają osobom powyżej 65 roku, a także dzieciom w ciągu dwóch pierwszych lat życia. Ponadto, na infekcje S. pneumoniae szczególnie narażone są osoby z przewlekłymi chorobami serca, płuc, wątroby i nerek, chorzy na cukrzycę, a także osoby z osłabioną odpornością. Bakterie te rozprzestrzeniają się drogą kropelkową.

107 Streptococcus pneumoniae - test jakościowy + ilościowy, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 106 i polega na wykrywaniu obecności i oznaczeniu ilości kopii DNA dwoinki zapalenia płuc ( Streptococcus pneumoniae ). Możliwość określenia ilości bakterii we krwi, pozwala oszacować stan bakteriemii oraz monitorować jej zmiany w trakcie leczenia.

132 Streptococcus pyogenes - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA paciorkowca ropnego (Streptococcus pyogenes). Streptococcus pyogenes to Gram(+) paciorkowiec, który jest głównym czynnikiem etiologicznym anginy. Ponadto S. pyogenes może wywoływać zapalenie węzłów chłonnych, liszajec, różę, zapalenie naczyń limfatycznych, ucha środkowego i inne. Szczepy wytwarzające toksyny mogą ponadto powodować płonicę, paciorkowcowy zespół wstrząsu toksycznego czy martwicze zapalenie powięzi.

133 Streptococcus spp. - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA 24 gatunków paciorkowców z rodzaju Streptococcus, tj.:S. pneumoniae, S. agalactiae, S. pyogenes, S. mitis, S. anginosus, S. gordonii, S. intermedium, S. orali, S. parasanguinis, S. sanguinis, S. vestibularis, S. alactolyticus, S. criceti, S. downei, S. feruj, S. gallinaceus, S. hyointestinalis, S. lutetiensis, S. macacae, S. parauberis, S. suis, S. constellatus subsp. constellatus, S. cristatus, S. mutans. Test nie umożliwia jednak rozpoznania gatunku gronkowca obecnego w badanym materiale. Jeśli istnieje konieczność identyfikacji gatunkowej paciorkowców należy wykonać test numer 718 , który umożliwia wykrycie tych samych gatunków paciorkowców wraz z jednoczesną identyfikację gatunkową S. agalactiae, S. mitis, S. pneumoniae i S. pyogenes.

150 Yersinia enterocolitica - test jakościowy, Real-Time PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA bakterii Yersinia enterocolitica, będącej czynnikiem etiologicznym zakaźnej choroby bakteryjnej zwanej Jersiniozą.
Pałeczki Yersinia wnikając do organizmu drogą doustną namnażają się w świetle przewodu pokarmowego przylegając do powierzchni błony śluzowej jelita cienkiego. Następnie na drodze endocytozy mogą przedostać się do zrębu błony śluzowej i dalej aż do węzłów chłonnych. W zależności od stanu odporności gospodarza oraz zjadliwości szczepu może dojść do rozprzestrzenieniem się ich do układu krwionośnego wywołując m.in. zapalenie węzłów chłonnych, zapalenie wsierdzia, posocznicę, zakażenie skóry, rumień guzowaty, reaktywne zapalenie stawów, zapalenie tarczycy czy mięśnia sercowego. Choroba dotyka przede wszystkim dzieci, a do najczęstszych jej objawów należą: gorączka, bóle brzucha, biegunka (często krwawa). Pojawiają się one zwykle miedzy 4 a 7 dniem od zakażenia i mogą trwać od 1 do 3 tygodni bądź dłużej.Yersinia enterocolitica jest zaliczana do najczęściej występujących z rodzaju Yersinia w Europie. Bakteria ta jest szeroko rozpowszechniona w przyrodzie. Głównym rezerwuarem tej bakterii jest trzoda chlewna, ale też psy, koty, zwierzęta dzikie oraz ptaki. Najczęściej do infekcji dochodzi po spożyciu skażonej żywności.

151 Yersinia enterocolitica - test ilościowy, Real-Time PCR

Test ten jest modyfikacją testu nr 150 i polega na wykrywaniu obecności wraz z oznaczeniem ilości kopii genomowego DNA bakterii Yersinia enterocolitica wywołującej jersiniozę. Umożliwia to monitorowanie zmian ilości bakterii w organizmie w trakcie choroby i leczenia.

146 Badanie lekooporności na metycylinę (mecA) i antybiotyki z grupy glikopeptydów (vanA, vanB) - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności 3 genów oporności na antybiotyki: mecA, vanA i vanB u bakterii. Gen mecA warunkuje odporność na metycylinę, ponieważ umożliwia syntezę zmodyfikowanego białka PBP2 (zwanego PBP2' lub PBP2a), które przejmuje funkcje inaktywowanego przez antybiotyki białka niezbędnego do syntezy ściany komórkowej. Odporność na metycylinę ma największe znaczenie kliniczne u gronkowców. Gen oporności na wankomycynę vanA warunkuje bardzo dużą oporność na glikopeptydy, a więc zarówno na wankomycynę, jak i teikoplaninę. Najczęściej występuje u enterokoków (E. faecium, E. faecalis), jednak z uwagi na plazmidowe umiejscowienie genu, może dojść do jego przekazania innym gatunkom czy szczepom bakterii. Gen vanB warunkuje odporność na wankomycynę, ale nie powoduje oporności bakterii na teikoplaninę. Podobnie jak w przypadku vanA gen ten występuje głównie u enterokoków (E. faecium, E. faecalis).

502 Candida tropicalis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA drożdżaków Candida tropicalis , które podobnie jak C. albicans mogą wywoływać kandydozę. Choroba ta spowodowana jest niekontrolowanym rozmnażaniem się drożdży bytujących w przewodzie pokarmowym człowieka, wywołując zakażenie ogólnoustrojowe. Najczęściej dochodzi do niej po kuracjach antybiotykowych oraz u osób o obniżonej odporności. Niezależnie od gatunku Candida, który wywołał chorobę objawy kliniczne infekcji są zbliżone. Kandydoza doprowadza do niewydolności systemu immunologicznego i nieleczona może przyczyniać się do wystąpienia poważnych chorób. Grzyby Candida wydzielają bardzo szkodliwe mykotoksyny, które mogą zakłócać pracę układu nerwowego i odpornościowego. Badania molekularne oparte na wykrywaniu DNA tego patogena we krwi są wysoce specyficzne i pozwalają wykryć nawet niewielkie ilości chorobotwórczych grzybów w organizmie.

501 Candida albicans - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA drożdżaków Candida albicans , wywołujących kandydozę (drożdżycę, bielnicę). Choroba ta spowodowana jest niekontrolowanym rozmnażaniem się drożdży bytujących w przewodzie pokarmowym człowieka, wywołując zakażenie ogólnoustrojowe. Najczęściej dochodzi do niej po kuracjach antybiotykowych oraz u osób o obniżonej odporności. Kandydoza doprowadza do niewydolności systemu immunologicznego i nieleczona może przyczyniać się do wystąpienia poważnych chorób. Grzyby Candida wydzielają bardzo szkodliwe mykotoksyny, które mogą zakłócać pracę układu nerwowego i odpornościowego. Badania molekularne oparte na wykrywaniu DNA tego patogena we krwi są wysoce specyficzne i pozwalają wykryć nawet niewielkie ilości chorobotwórczych grzybów w organizmie.

503 Candida parapsilosis - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA drożdżaków Candida parapsilosis , które podobnie jak C. albicans mogą wywoływać kandydozę. Candida parapsilosis jest komensalem człowieka, który najczęściej zasiedla śluzówkę jelit jamy ustnej, gardła i dróg moczowych. Drożdżak ten jest bardzo groźnym patogenem dla osób z upośledzoną odpornością i noworodków (zwłaszcza wcześniaków). Może być przyczyną zakażeń szpitalnych w tym sepsy.

504 Candida glabrata - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA drożdżaków Candida glabrata , które podobnie jak C. albicans mogą wywoływać kandydozę. Do niedawna uważano C. glabrata, za nie chorobotwórczego drożdżaka. Obecnie wiadomo, że jest to wysoce oportunistyczny patogen dróg moczowo-płciowych oraz układu krążenia. Jest to szczególnie niebezpieczny drobnoustrój dla osób starszych i HIV-pozytywnych.

505 Candida krusei - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA drożdżaków Candida krusei , które podobnie jak C. albicans mogą wywoływać kandydozę. C. krusei jest bardzo ważnym czynnikiem etiologicznym zakażeń szpitalnych, zwłaszcza w przypadku osób o obniżonej odporności. Posiada naturalną odporność na flukonazol, standardowy lek przeciwgrzybiczy. Z tego powodu jest często spotykany u pacjentów po kuracji tym lekiem. Śmiertelność w wyniku grzybicy ogólnoustrojowej wywołanej przez C. krusei jest znacznie większa niż w przypadku częstszych grzybic wywołanych przez C. albicans.

506 Aspergillus fumigatus - test jakościowy, PCR

Test polega na wykrywaniu obecności DNA kropidlaka Aspergillus fumigatus. A. fumigatus jest bardzo niebezpiecznym patogenem dla osób w immunosupresji. Wywołuje grzybice narządowe między innymi nerek, płuc, oskrzeli czy mózgu. Często zasiedla jamy pogruźlicze na płucach, a także miejsca ponowotworowe, czy zwłóknieniowe. Choroba nieleczona prowadzi do zgonu. Metody molekularne w przypadku tego patogena, takie jak PCR, umożliwiają szybką i niezwykle czułą diagnostykę.

716 Panel INFEKCJE WIRUSOWE: identyfikacja 5 wirusów: CMV, HSV I/II, poliomawirusy JC/BK, Enterowirusy, test jakościowy Real-Time PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających wykrywaniu materiału genetycznego 5 grup wirusów, tj.: wirusa cytomegalii (CMV), wirusa opryszczki wargowej (HSV1), wirusa opryszczki narządów płciowych (HSV2), poliomawirusów JCV i BKV oraz enterowirusów, w tym 23 wirusów Coxsackie A, 6 wirusów Coxsackie B, 28 echovirusów i 5 niesklasyfikowanych enterowirusów. Panel ten jest szczególnie przydatny w diagnostyce niezidentyfikowanych, wirusowych infekcji ogólnoustrojowych u osób w immunosupresji.

717 Panel STAPHYLOCOCCUS - wykrywanie 22 gatunków z rodzaju Staphylococcus wraz z identyfikacją S. aureus, S. epidermidis, S. haemolyticus - test jakościowy, multiplex PCR

Test obejmuje badanie genetyczne polegające na wykrywaniu obecności DNA 22 gatunków gronkowców wraz z identyfikacją S. aureus, S. epidermidis, S. haemolyticus. Wśród wykrywanych gronkowców, oprócz 3 wspomnianych powyżej gatunków znajdują się: S. pasteuri, S. warneri, S. cohnii subsp. urealyticum, S. hominis subsp. hominis, S. caprae, S. xylosus, S. equorum, S. simulans, S. arlettae, S. kloosii, S. gallinarum, S. auricularis, S. chromogenenes, S. delphini, S. intermedium, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. lugdunensis, S. capitis subsp. ureplyticus oraz S. schleiferi subspp. Scheleiferi. Panel ten jest szczególnie przydatny w sytuacjach podejrzenia infekcji wywołanej przez gronkowce.

718 Panel STREPTOCOCCUS - wykrywanie 24 gatunków z rodzaju Streptococcus wraz z identyfikacją S. pneumoniae, S. agalactie, S. pyogenes, S. mitis - test jakościowy, multiplex PCR

Test obejmuje badanie genetyczne polegające na wykrywaniu obecności DNA 24 gatunków paciorkowców wraz z identyfikacją S. agalactiae, S. mitis, S. pneumoniae i S. pyogenes. Wśród wykrywanych gatunków paciorkowców, oprócz 4 wspomnianych powyżej gatunków znajdują się: S. pneumoniae, S. agalactiae, S. pyogenes, S. mitis, S. anginosus, S. gordonii, S. intermedium, S. orali, S. parasanguinis, S. sanguinis, S. vestibularis, S. alactolyticus, S. criceti, S. downei, S. feruj, S. gallinaceus, S. hyointestinalis, S. lutetiensis, S. macacae, S. parauberis, S. suis, S. constellatus subsp. constellatus, S. cristatus, S. mutant. Panel ten jest szczególnie przydatny w sytuacjach podejrzenia infekcji wywołanej przez paciorkowce.

719 Panel GRAM(-) BAKTERIE - identyfikacja 10 gatunków bakterii Gram ujemnych - test jakościowy, multiplex PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności DNA i identyfikacji gatunkowej 10 pałeczek Gram ujemnych. Wśród identyfikowanych gatunków znajdują się: Acinetobacter baumanii, Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens i Stenotrophomonas maltophilia. Panel ten jest szczególnie przydatny w sytuacjach podejrzenia infekcji wywołanej przez pałeczki Gram ujemne.

720 Panel INFEKCJE GRZYBICZE - identyfikacja 6 gatunków: Candida albicans, Candida tropicalis, Candida parapsilosis, C. glabrata, C. krusei, Aspergillus fumigatus - test jakościowy, multiplex PCR

Test obejmuje panel badań genetycznych polegających na wykrywaniu obecności DNA i identyfikacji gatunkowej 6 gatunków grzybów patogennych dla człowieka. Wśród identyfikowanych gatunków znajdują się: Candida albicans, Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata, Candida krusei i Aspergillus fumigatus. Grzybicze infekcje ogólnoustrojowe są bardzo niebezpieczne, głównie z powodu ogromnych trudności w ich wczesnym i prawidłowym rozpoznaniu. Diagnostyka infekcji powodowanych przez grzyby oparta była dotychczas na metodach konwencjonalnych, takich jak hodowle czy ocena mikroskopowa, co znacznie wydłużało czas diagnozy i w większości przypadków utrudniało właściwą identyfikację gatunkową patogenu. Niniejszy panel genetyczny jest pierwszym testem diagnostycznym w kraju, który umożliwia szybką, specyficzną i niezwykle czułą diagnostykę infekcji grzybiczych.

721 Panel SEPSA - wykrywanie 65 gatunków patogenów wraz z określeniem lekooporności na metycylinę (mecA) i antybiotyki z grupy glikopeptydów (vanA, vanB), test jakościowy, multiplex PCR

Jest to pierwszy panel badań genetycznych w Polsce, umożliwiający niezwykle czułe, specyficzne i szybkie wykrycie najczęstszych czynników chorobotwórczych wywołujących sepsę. Sepsa jest ciężką chorobą inwazyjną, powstającą w wyniku reakcji zapalnej organizmu na zakażenie o etiologii mikrobiologicznej. Prowadzi do niewydolności narządów wewnętrznych i charakteryzuje się wysoką śmiertelnością. Ta wysoka śmiertelność chorych na sepsę wynika przede wszystkim z ogromnych trudności w prawidłowym rozpoznaniu choroby, jak i zidentyfikowaniu drobnoustroju, który ją spowodował, we wczesnym stadium. Dotychczas diagnostyka sepsy oparta była na długotrwałych i zawodnych metodach hodowlanych. Obecnie, nowoczesna diagnostyka molekularna proponuje nowe rozwiązania, których celem jest wsparcie lekarzy w szybkim i trafnym podejmowaniu decyzji terapeutycznych. Oferowany test do diagnostyki sepsy łączy wszystkie zalety biologii molekularnej, gwarantując wiarygodny i szybki sposób na wykrywanie patogenów zarówno we krwi jak i płynach ustrojowych osób chorych. Oferowany panel genetyczny umożliwia wykrycie aż 65 patogenów chorobotwórczych, które mogą wywoływać posocznicę, w tym:

• 22 gatunków gronkowców wraz z identyfikacją Staphylococcus aureus, Staphylococcus epidermidis i Staphylococcus haemolyticus. Wśród wykrywanych gronkowców, oprócz 3 wspomnianych powyżej gatunków znajdują się: S. pasteuri, S. warneri, S. cohnii subsp. urealyticum, S. hominis subsp. hominis, S. caprae, S. xylosus, S. equorum, S. simulans, S. arlettae, S. kloosii, S. gallinarum, S. auricularis, S. chromogenenes, S. delphini, S. intermedium, S. hominis subsp. novobiosepticus, S. lugdunensis, S. capitis subsp. ureplyticus oraz S. schleiferi subspp. Scheleiferi;

• 24 gatunków paciorkowców wraz z identyfikacją Streptococcus agalactiae, Streptococcus mitis, Streptococcus pneumoniae i Streptococcus pyogenes. Wśród wykrywanych gatunków paciorkowców, oprócz 4 wspomnianych powyżej znajdują się: S. anginosus, S. gordonii, S. intermedium, S. orali, S. parasanguinis, S. sanguinis, S. vestibularis, S. alactolyticus, S. criceti, S. downei, S. feruj, S. gallinaceus, S. hyointestinalis, S. lutetiensis, S. macacae, S. parauberis, S. suis, S. constellatus subsp. constellatus, S. cristatus, S. mutant;

• 10 pałeczek Gram ujemnych wraz z ich identyfikacją: Acinetobacter baumanii, Enterobacter aerogenes, Enterobacter cloacae, Escherichia coli, Klebsiella oxytoca, Klebsiella pneumoniae, Proteus mirabilis, Pseudomonas aeruginosa, Serratia marcescens i Stenotrophomonas maltophilia;

• 2 gatunków bakterii z rodzaju Enterococcus, tj.: Enterococcus faecium i Enterococcus faecali;.

• dwoinki zapalenia opon mózgowo-rdzeniowych Neisseria meningitidis;

• 6 gatunków grzybów wraz z ich identyfikacją: Candida albicans, Candida tropicalis, Candida parapsilosis, Candida glabrata, Candida krusei i Aspergillus fumigatus;

• 3 genów oporności na antybiotyki (metycylina i antybiotyki z grupy glikopeptydów ) u bakterii: mecA, vanA i vanB.